Las líneas de investigación propuestas por el CEII, son las siguientes:

–    Interculturalidad, Inclusión y Equidad: Procesos migratorios e interculturales en la Región del Maule, Políticas públicas e inclusión en el contexto migratorio.

–    Interculturalidad y Sociedad: Discurso y diversidad cultural.

–    Educación Intercultural y Procesos Aculturativos: Formación en interculturalidad, Inclusión y exclusión en contextos formativos interculturales.