Francisco Adasme Carreño

Académico Auxiliar

Formación Académica

– PhD en Ciencias Aplicadas, (Universidad de Talca, Chile)
-Ingeniero en Bioinformática (Universidad de Talca, Chile)

Descripción Líneas de Investigación

Estudio de la estructura de proteínas y su interacción con pequeñas moléculas mediante química computacional. Mi investigación se enfoca en el estudio de los fundamentos fisicoquímicos de la estructura y plegamiento de proteínas a través de métodos de estructura electrónica, los cuales modelan correctamente las interacciones interatómicas que rigen este suceso. Esta aproximación provee información precisa sobre la energética del plegamiento, y que, a su vez, ayuda a describir y comprender el mecanismo subyacente del proceso. Adicionalmente, he investigado la interacción de moléculas pequeñas con distintas proteínas involucradas en una serie de procesos fisiológicos mediante métodos computacionales que proveen información que ayuda a entender el mecanismo así como también a diseñar nuevas terapias para enfermedades.

Áreas de interés:
Estructura de proteínas
– Aplicación de la química cuántica en sistemas orgánicos y biológicos
– Diseño de drogas basado en estructura molecular y asistido por computador
– Programación aplicada a la química computacional

Colaboraciones principales:
– Joel Ireta, Universidad Autónoma Metropolitana, México
– Julio Caballero, Universidad de Talca, Chile

Publicaciones Relevantes

1. Adasme-Carreño, F., Caballero, J., & Ireta, J. (2021). PSIQUE: Protein secondary structure identification on the basis of quaternions and electronic structure calculations. Journal of Chemical Information and Modeling, 61(4), 1789-1800.
2. Adasme-Carreno, F., Alzate-Morales, J., & Ireta, J. (2017). Modeling cooperative effects in halogen-bonded infinite linear chains. Physical Chemistry Chemical Physics, 19(28), 18529-18538.
3. Adasme-Carreño, F., Munoz-Gutierrez, C., & Alzate-Morales, J. H. (2016). Halogen bonding in drug-like molecules: A computational and systematic study of the substituent effect. RSC advances, 6(66), 61837-61847.
4. Adasme-Carreño, F., Muñoz-Gutiérrez, C., Salinas-Cornejo, J., & Ramírez, C. C. (2015). A2EPG: a new software for the analysis of electrical penetration graphs to study plant probing behaviour of hemipteran insects. Computers and Electronics in Agriculture, 113, 128-135.
5. Misini Ignjatović, M., Caldararu, O., Dong, G., Munoz-Gutierrez, C., Adasme-Carreno, F., & Ryde, U. (2016). Binding-affinity predictions of HSP90 in the D3R Grand Challenge 2015 with docking, MM/GBSA, QM/MM, and free-energy simulations. Journal of Computer-Aided Molecular Design, 30, 707-730.

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